透明状态下的申请流程
对于马来西亚的低成本房屋和中国的经济适用房来说，如何保证公开透明的状态下申请，成为困扰两国政府的问题之一。
两国在对申请用户资格审核方面都力求做到公平、透明，对申请用户的背景资料进行层层审核。但在资格审核的全面性和操作性上，马来西亚开放注册系统ORS则设计得更为成功，首先将生活成本和CPI指数列入分配考虑的因素之中，可以真实地反映申请家庭的生活水平。其次是申请形式简单，修正后的ORS系统规定，申请低成本房屋只需要上交身份证复印件即可从中心数控系统(a central computerized database system)调去网络资料，并不需要其他复杂的文件，既简化了书面申请的繁杂，又可以保证该保障只被马来西亚市民享有。中国的经济适用房用户资格审核要经历三层审核，两次公示，虽然程序严谨复杂，但却是以时间为代价的，从申请者提交申请到审核成功往往要耗时数月之久。
在低成本房屋购买资格认定上，马来西亚州政府普遍使用电脑化的公开注册系统，该系统向全社会开放，凡月家庭收入少于1500令吉的欲购廉价者均可在州政府提供的电脑终端上录入自己的信息资料，并向当地房屋局提供有关收入证明（如领薪单）。当地房屋局对其资料进行审核。该系统在全马联网，其中央控制系统设在房屋及地方政府部，可对全马各州廉价或廉租屋的申请及批准情况随时监控，并有权进入各州政府保存的注册信息网。在第九个五年计划中，马政府计划对这些注册信息进行定时更新，并将修改申请者的条件，各州统一审核标准，除收入水平以外，申请购房的弱势群体（如单身母亲、家中多位受赡养者以及残疾人等）将优先购房。这种模式在很大程度上保证了对于低成本住房分配的相对公平。
| 马来西亚 | 中国 |
| 低成本房屋（经济适用房）申请流程透明状态更为成功 | 不及马来西亚在透明状态下的申请流程 成功 |
中国的主要问题为申请流程复杂，易产生暗箱操作。相比马来西亚完善的开放注册系统，中国经济适用房由于缺乏个人资产收入认定系统和全国联网的个人信用系统，申请用户的收入、资产认定很大程度上依靠公示以及多部门交叉验证，审核工作流于表面，造成目前经济适用房申请流程复杂，增加了暗箱操作的可能，很容易造成询私舞弊。
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